A kutatók egy titokzatos gént fedeztek fel a SARS-CoV-2 koronavírus genetikai kódjában, amely szegmens szinte el van rejtve a vírus genomjában, és még mindig figyelmen kívül marad.
A nemrégiben azonosított gén – az ORF3d – egy példa az átfedő génnek: egyfajta „gén egy génben”, amely hatékonyan elrejti magát a nukleotidok láncában, mivel átfedi egymást más gének kódolt szekvenciáival.
“A genom méretét tekintve a SARS-CoV-2 és rokonai a létező leghosszabb RNS vírusok közé tartoznak” – magyarázza Chase Nelson bioinformatikus, az Amerikai Természettudományi Múzeum munkatársa.
“Így érzékenyebbek a” genomi trükkökre “, mint más RNS vírusok.”
A vírusok valójában meglehetősen hajlamosak az átfedő génekre, így ez nem éppen meglepő felfedezés. Meg kell még nézni, hogy az ORF3d valóban genomi hoax-e, de mindenképpen nehéz belátni.
Az átfedő géneket nehéz azonosítani a genetikai szekvenciákban, mert a genomi pásztázó rendszerek gyakran átugorhatják őket a genetikai kód sorainak beolvasásakor: egyedi gének kiválasztására vannak programozva, de nem feltétlenül látnak átfogó utasításokat, amelyek közösek a szomszédos gének nukleotidjainál a szekvenciában.
A SARS-CoV-2 vírusrészecskék elektronmikroszkópiája. (NIAID).
Az olyan vírusok kapcsán, mint a SARS-CoV-2, ez komoly vakfoltot hozhat létre. A tudósok az év eleje óta igyekeznek a lehető legtöbbet megérteni erről a pusztító vírusról, és bár genetikai szerkezetének egyes aspektusait sikerült tisztázni (beleértve azt a szilárd meggyőződést is, hogy nem „a laboratóriumban jött létre”), csak sok minden van, amit még csak nem tudunk. .
“Az átfedő gének az egyik arzenálját jelenthetik a koronavírusok hatékony replikációjának, a gazdaszervezet immunitásának aláásásának vagy önmaguk továbbadásának a fejlődésében.”
Ami az ORF3d-t illeti, még mindig sokat kell megtudni arról, hogy miért létezik, elrejtőzik a genomban és átfedi más géneket.
A COVID-19 betegek korábbi vérvizsgálata alapján a titokzatos génről egy dolgot biztosan tudunk, hogy az ORF3d erős antitest-választ vált ki.
“Még nem tudjuk a funkcióját és a klinikai jelentőségét” – mondja Nelson.
“De azt jósoljuk, hogy ezt a gént viszonylag valószínűtlen, hogy egy T-sejt-válasz képes kimutatni, szemben az antitest-válasszal. És talán köze van ahhoz, hogy a gén hogyan tudott felmerülni.
Egy dolog biztos. Egy olyan vírus esetében, amelynek csak körülbelül 15 ismert génje van, még egy újabb felfedezése, nemhogy egy átfedő gén, jelentős előrelépés. Hogy mennyire fontos, a tudósok most megpróbálják kideríteni.
Az eredményeket az eLife-nek jelentjük.
